1994 г. – открыта Национальная высшая школа государственного управления при Президенте Республики Казахстан (НВШГУ) (на базе Высшей партийной школы при ЦК КП Казахской ССР, созданной в 1942 году).

1998 г. – создана Академия государственной службы при Президенте Республики Казахстан путем слияния НВШГУ при Президенте Республики Казахстан и Института переподготовки и повышения квалификации государственных служащих при Правительстве Республики Казахстан.

2000 г. – передислокация Академии государственной службы при Президенте Республики Казахстан в столицу страны – город Астану.

2005 г. – образована Академия государственного управления при Президенте Республики Казахстан путем слияния государственных учреждений «Академия государственной службы при Президенте Республики Казахстан», «Судебная академия при Верховном суде Республики Казахстан» и передачи функций Дипломатической академии РГКП «Евразийский национальный университет имени Л. Н. Гумилева» вновь образованному государственному учреждению.

2008 г. – Академия реорганизована в республиканское государственное казенное предприятие (РГКП). С целью подготовки государственных служащих высшего звена в составе Академии образована Национальная школа государственной политики.
Органом государственного управления Академии определено Министерство по делам государственной службы Республики Казахстан.

2012 г. – начата реализация совместного с Европейским Союзом проекта по реформированию Академии. Принята (в мае 2012 года) и реализуется новая Концепция развития Академии. Впервые внедрены признанные в мире образовательные программы MPA (Master of Public Administration), MPP (Master of Public Policy), DPA (Doctor of Public Administration), DPP (Doctor of Public Policy) по подготовке магистров и докторов наук новой формации для государственной службы Казахстана.

2014 г. – утверждена Стратегия развития Академии государственного управления при Президенте Республики Казахстан до 2020 года, которая разработана с целью дальнейшей модернизации системы обучения государственных служащих на основе компетентностного и практико-ориентированного подходов развития новых направлений и в связи с необходимостью повышения конкурентоспособности на рынке образовательных услуг в странах СНГ и ШОС.

2017-2018 годы – в областных центрах и городах Алматы и Шымкент образованы 16 филиалов Академии государственного управления при Президенте Республики Казахстан

2019 году – утверждена Стратегия Академии государственного управления при Президенте Республики Казахстан на 2020-2023 годы, включающая 8 стратегических инициатив.